Việc xác định “nhầm” loại vi rút và tiếp theo đó tiêm chủng nhiều lần mang lại nguy cơ làm suy giảm hệ thống miễn dịch của cơ thể. Tuy hiếm khi xảy ra, nhưng đây vẫn được coi là một nguy cơ. Có nhiều loại vaccine kháng vi rút được quảng cáo rầm rộ và được quảng cáo sớm thậm chí cho thấy tác động tiêu cực và âm ỉ, đáng chú ý là vaccine bệnh bại liệt tại Ấn Độ bị thu hồi hàng loạt vào năm 2018 do kém chất lượng (1) Ngoài ra, vaccine “6-trong-1” chống vi rút bạch hầu, ho gà, uốn ván, bại liệt, viêm gan B, viêm màng não mủ cũng được thu hồi năm 2012 do nghi ngờ khu vực bào chế có khả năng nhiễm vi sinh vật (2)